主要執行各地農田灌溉系統水質受廢污水污染後經由引灌作業導致農田受到污染，或因污染洩漏導致鄰近之土壤受污染，或因廢棄物非法棄置及掩埋有害物質，經由土壤之物理、化學及生物擴散至鄰近土壤等特定事件，選定最佳污染改善方案進行全場整治工作。除此之外，亦協助公部門執行改善專案監督工作，以避免造成二次污染，並依土壤及地下水污染整治法解除污染控制場址列管。